Почетный член Президиума международного парламента Всемирной конфедерации рыцарей, работающих под эгидой ООН; академик Академии технологических наук Российской Федерации; почетный академик Международной академии информатизации; член Международной Академии регионального развития и сотрудничества; почетный профессор Московского государственного института международных отношений МИД РФ.
Лауреат премий:
Международной премии Татарского народа имени Кул Гали (1994 г.);
премии Союза журналистов РФ "За открытость в общении с прессой" (1997 г.);
национальной премии в области развития связей с общественностью "Серебряный Лучник", учрежденной Союзом журналистов, Торгово-промышленной палатой РФ и Российской ассоциацией по связям с общественностью (1997 г.);
национальной театральной премии РФ "Золотая маска" в номинации "За поддержку театрального искусства России" по итогам сезона 1997-98 гг.; премии "Российский Национальный Олимп" в номинации "Президент года" (2001, 2004 гг.).
В июне 2001 г. генеральный директор ЮНЕСКО Коитиро Мацуура вручил Минтимеру Шаймиеву серебряную медаль имени Авиценны за большой вклад в сохранение культурно-исторических ценностей.
В 2004 г. награжден орденом "За Честь и Доблесть" премии "Российский Национальный Олимп".
В феврале 2004 г. награжден орденом "Ахьдз-апша второй степени" (Республика Абхазия).
В марте 2005 г. награжден дипломом и памятной медалью "Россия - ЮНЕСКО" за личный вклад в сотрудничество между Российской Федерацией и ЮНЕСКО.
В июне 2005 г. награжден орденом почета "Аль-Фахр" первой степени.
В сентябре 1997 г. - Орденом Русской Православной Церкви Святого Благоверного князя Даниила Московского I степени, в июле 2005 г. - Орденом Русской Православной Церкви Преподобного Сергия Радонежского I степени.
Лауреат Государственной премии мира и прогресса Первого Президента Республики Казахстан (2005 г.).
В 2005 г. награжден орденом Минина и Пожарского «Возвеличим Россию».
Лауреат Международной премии имени короля Фейсала за 2007 г.
В 2008 г. награжден Олимпийским Орденом (за выдающийся вклад в развитие Олимпийского движения).
Почетный гражданин города Казани (2005 г.), Почетный гражданин Республики Алтай (2007 г.).
В 2010 г. награжден Орденом Дружбы Республики Казахстан 1 степени.
Орден "За заслуги перед Республикой Дагестан" (2017 г.)